Στα πλαίσια του προγράμματος παρακολούθησης πραγματοποιούνται οι εξής δράσεις:
Παρακολούθηση ορνιθοπανίδας.
Συγκεκριμένα, γίνεται:
- Καταμέτρηση αποικιών υδρόβιων, καλοβατικών ή παρυδάτιων πουλιών (μικτές αποικίες κορμοράνων – ερωδιών – καλοβατικών ειδών, πλατφόρμες φωλιάσματος πελεκάνων, εξέδρες γλαρονιών, φωλεάζοντα παρυδάτια). Η υλοποίηση του προγράμματος γίνεται στη διάρκεια της αναπαραγωγικής περιόδου (άνοιξη). Στα πλαίσια της δράσης αυτής γίνεται και δαχτυλίωση των νεοσσών των πελεκάνων στις τεχνητές πλατφόρμες δεκαπενθήμερο του Ιουνίου.
- Εντοπισμός επικρατειών και φωλιών αρπακτικών πουλιών (θαλασσαετός, κραυγαετός, γερακαετός, τσίφτης κ.ά.). Η δράση πραγματοποιείται σε συγκεκριμένες διαδρομές στην προστατευόμενη περιοχή (ορεινή και πεδινή περιοχή).
- Μηνιαίες καταμετρήσεις πουλιών στη λίμνη. Η δράση υλοποιείται καθ’ όλη τη διάρκεια του έτους σε συγκεκριμένη διαδρομή περιμετρικά της λίμνης και καταγράφονται τα είδη που παρατηρούνται στις 12 περιοχές στις οποίες έχει χωριστεί η λίμνη.
Παρακολούθηση φυσικοχημικών παραμέτρων και κλιματικών δεδομένων.
Ο Φορέας Διαχείρισης με τα κατάλληλα εργαστηριακά όργανα διενεργεί μετρήσεις ποιότητας των επιφανειακών νερών που αφορούν σε παραμέτρους όπως η θολερότητα, η αγωγιμότητα, η θερμοκρασία, το διαλυμένο οξυγόνο, το pΗ, χρώμα, αμμωνία, νιτρικά, φώσφορος, κ.ά. Οι δειγματοληψίες πραγματοποιούνται σε πέντε συνολικά σημεία στη λίμνη και στον ποταμό ανάντη της λίμνης, μία φορά το μήνα καθ’ όλη τη διάρκεια του έτους. Τα στοιχεία τα οποία καταγράφονται στην παρούσα δράση αφορούν παραμέτρους οι οποίοι είναι σε σύνδεση με τις απαιτήσεις της Οδηγίας 60/2000 των νερών (Ν. 3199/2003 ΦΕΚ 280Α/2003).
Η καταγραφή κλιματικών δεδομένων γίνεται μέσω των δύο μετεωρολογικών σταθμών που βρίσκονται εγκατεστημένοι στον Λιθότοπο και στο Αχλαδοχώρι καθώς και ενός σταθμήμετρου στο ποταμό Στρυμόνα.
Παρακολούθηση σημαντικών ειδών θηλαστικών. Η παρούσα δράση επικεντρώνεται στην παρακολούθηση της βίδρας, του τσακαλιού, των τρωκτικών και των νυχτερίδων. Υλοποιείται καθ’ όλη την διάρκεια του χρόνου.
Παρακολούθηση τύπων οικοτόπων. Γίνεται καταγραφή της υπάρχουσας κατάστασης των οικοτόπων της περιοχής του Εθνικού Πάρκου, σε μια προσπάθεια ενημέρωσης της υπάρχουσας χαρτογράφησης των τύπων οικοτόπων για την περιοχή. Σημειώνεται ότι κατά το 2011 αναγνωρίσθηκε και καταγράφηκε νέος τύπος οικοτόπου προτεραιότητας για την περιοχή του Εθνικού Πάρκου στον ορεινό όγκο Κερκίνης (Μπέλες). Είναι τα Μεσογειακά Δάση Ίταμου (Taxus baccata) με κωδικό 9850*.
Αποτύπωση ανθρωπογενών δραστηριοτήτων στην περιοχή του Εθνικού Πάρκου.
Για την αποτίμηση των έμμεσων ανθρωπογενών δραστηριοτήτων στην πανίδα του Εθνικού Πάρκου, γίνεται:
α. Παρακολούθηση νεκρών ζώων στους οδικούς άξονες. Ο Φορέας εφαρμόζει μηνιαία παρακολούθηση για σκοτωμένα ζώα (είδος, αριθμό και θέση) σε όλη την προστατευόμενη περιοχή ακολουθώντας συγκεκριμένες διαδρομές στους κύριους οδικούς άξονες.
β. Παρακολούθηση νεκρών πουλιών στο αιολικό πάρκο Σιδηροκάστρου.
